| 発行日 | 種類 | タイトル | 発行所 | 判型 | 備考 | |
| 1986年05月02日号 〜1987年06月12日号 |
- | 週刊少年チャンピオン | 秋田書店 | B5判 | 読切連載 | - |
| 1987年07月10日号 〜09月18日号 |
- | 週刊少年チャンピオン | 秋田書店 | B5判 | 読切連載 | - |
| 1986年10月01日 | チャンピオンコミックス | ミッドナイト1 | 秋田書店 | 新書判 | - |
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| 1986年12月15日 | チャンピオンコミックス | ミッドナイト2 | 秋田書店 | 新書判 | - |
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| 1987年02月05日 | チャンピオンコミックス | ミッドナイト3 | 秋田書店 | 新書判 | - |
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| 1987年05月05日 | チャンピオンコミックス | ミッドナイト4 | 秋田書店 | 新書判 | - |
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| 1987年09月25日 | チャンピオンコミックス | ミッドナイト5 | 秋田書店 | 新書判 | - |
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| 1988年01月05日 | チャンピオンコミックス | ミッドナイト6 | 秋田書店 | 新書判 | - |
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| 1995年03月16日 | 手塚治虫漫画全集354巻 | ミッドナイト1 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1995年04月17日 | 手塚治虫漫画全集355巻 | ミッドナイト2 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1995年05月17日 | 手塚治虫漫画全集356巻 | ミッドナイト3 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1995年06月16日 | 手塚治虫漫画全集357巻 | ミッドナイト4 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1995年07月17日 | 手塚治虫漫画全集358巻 | ミッドナイト5 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1995年08月17日 | 手塚治虫漫画全集359巻 | ミッドナイト6 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1998年01月 | 秋田文庫 | ミッドナイト1 | 秋田書店 | 文庫判 | - |
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| 1998年03月 | 秋田文庫 | ミッドナイト2 | 秋田書店 | 文庫判 | - |
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| 1998年05月 | 秋田文庫 | ミッドナイト3 | 秋田書店 | 文庫判 | - |
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| 1998年07月 | 秋田文庫 | ミッドナイト4 | 秋田書店 | 文庫判 | - |
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| 2000年07月10日 | ちくま文庫 | 手塚治虫ミステリー傑作集 | 筑摩書房 | 文庫判 | '86.8.22号収録 |
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| 2002年05月08日 | ちくま文庫 | 手塚治虫マンガ音楽館 | 筑摩書房 | 文庫判 | '87.4.10号収録 |
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| 2003年01月 | 講談社漫画文庫 | 恐怖短編集6「復讐の輪廻編」 | 講談社 | 文庫判 | '86.10.10号収録 |
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| 2003年05月10日 | 秋田文庫 | 手塚治虫アンソロジー猫傑作集1 | 秋田書店 | 文庫判 | ACT.3収録 |
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| 2003年08月10日 | 秋田文庫 | 手塚治虫アンソロジー猫傑作集2 | 秋田書店 | 文庫判 | ACT.51収録 |
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| 2003年10月10日 | 秋田文庫 | 手塚治虫アンソロジー犬傑作集 | 秋田書店 | 文庫判 | ACT.34収録 |
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| 2003年12月10日 | 秋田文庫 | 手塚治虫アンソロジー鳥傑作集 | 秋田書店 | 文庫判 | ACT.33収録 |
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| 2005年04月01日 | - | 手塚治虫マガジン4月号 | kkベストセラーズ | B5判 | ブラック・ジャック登場 | - |
| 2010年04月 | 手塚治虫文庫全集049 | ミッドナイト（1） | 講談社 | 文庫判 | - |
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| 2010年04月 | 手塚治虫文庫全集050 | ミッドナイト（2） | 講談社 | 文庫判 | - |
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| 2010年05月 | 手塚治虫文庫全集051 | ミッドナイト（3） | 講談社 | 文庫判 | - |
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| 2012年12月31日 | サンエイムック | ブラック・ジャック大解剖 | 三栄書房 | A4変形判 | 最終話収録 |
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| 2019年08月13日 | - | テヅコミ Vol.11 | マイクロマガジン社 | B5判 | ACT.29収録 |
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| 2023年06月16日 | - | 「ミッドナイト」ロストエピソード | 立東舎 | B5判 | 全集未収録作品 |
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